Timbul fenomena flood akibat tertembaknya Kaito. Ketika Nagai mengeluarkan IBM dalam jumlah yang banyak, Sato pun mengikutinya. Markas Iruma pun dipenuhi oleh begitu banyak hantu berwarna hitam. Sementara itu, Dr. Ikuya ogura, pionir penelitian IBM, menuju ke markas yang dipenuhi asap hitam dan sedang kacau. Situasinya pun semakin mendekati inti keberadaan Ajin.